El Puerto de Comodoro Rivadavia tiene certificado el Código Internacional para la Protección de los Buques y de las Instalaciones Portuarias (Código PBIP) en sus muelles para lograr operaciones seguras.
El Plan de Contingencias Ambientales (Planacon) está aprobado por la autoridad marítima en el marco del convenio internacional MARPOL.
La sostenibilidad del puerto y sus operaciones requieren altas estándares de calidad, certificados en la norma ISO 9001: 2015.
El puerto es miembro de la AIVP (Asociación Internacional Ciudades y Puertos) en la búsqueda una mejor vinculación Puerto-Ciudad.